Chiyo Sakura adalah seorang gadis SMA ceria yang telah jatuh cinta pada Umetarou Nozaki yang terlupakan. Banyak kebingungan Chiyo, ketika dia mengaku kepada Nozaki kesayangannya, dia memberinya tanda tangan yang tidak dikenalnya. Ternyata, remaja laki-laki yang tabah itu sebenarnya adalah shoujo mangaka yang dihormati, yang menerbitkan dengan nama pena Sakiko Yumeno! Serangkaian kesalahpahaman menyebabkan Chiyo menjadi salah satu asisten manga Nozaki.

Sepanjang kejadian lucu yang terjadi, dia berteman dengan banyak teman sekolahnya yang unik, termasuk sesama asistennya yang tampaknya tidak tahu malu, Mikoto Mikoshiba, dan “Pangeran Sekolah,” Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun mengikuti Chiyo saat dia berusaha untuk membantu Nozaki dengan manganya dan berharap bahwa dia pada akhirnya akan menyadari perasaannya.